Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm21976J3QNN2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Gm21976J3QNN2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Gm21976J3QNN2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Gm21976J3QNN2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Gm21976J3QNN2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Gm21976J3QNN2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Gm21976J3QNN2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Gm21976J3QNN2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21976J3QNN2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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