Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gm20828J3KMI7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm20828J3KMI7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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