Protein–RNA interactions for Protein: F7CNM6

1700056E22Rik, RIKEN cDNA 1700056E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700056E22RikF7CNM6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700056E22RikF7CNM6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700056E22RikF7CNM6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700056E22RikF7CNM6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
1700056E22RikF7CNM6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700056E22RikF7CNM6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700056E22RikF7CNM6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700056E22RikF7CNM6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700056E22RikF7CNM6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700056E22RikF7CNM6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700056E22RikF7CNM6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700056E22RikF7CNM6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700056E22RikF7CNM6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700056E22RikF7CNM6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
1700056E22RikF7CNM6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700056E22RikF7CNM6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700056E22RikF7CNM6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700056E22RikF7CNM6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 276 ms