Protein–RNA interactions for Protein: F6ZZG8

Gm5624, Predicted gene 5624 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5624F6ZZG8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5624F6ZZG8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5624F6ZZG8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5624F6ZZG8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5624F6ZZG8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5624F6ZZG8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5624F6ZZG8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5624F6ZZG8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5624F6ZZG8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5624F6ZZG8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5624F6ZZG8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5624F6ZZG8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5624F6ZZG8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5624F6ZZG8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5624F6ZZG8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5624F6ZZG8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5624F6ZZG8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5624F6ZZG8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5624F6ZZG8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5624F6ZZG8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5624F6ZZG8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5624F6ZZG8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5624F6ZZG8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5624F6ZZG8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm5624F6ZZG8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5624F6ZZG8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5624F6ZZG8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5624F6ZZG8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5624F6ZZG8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5624F6ZZG8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5624F6ZZG8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5624F6ZZG8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5624F6ZZG8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5624F6ZZG8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5624F6ZZG8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5624F6ZZG8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5624F6ZZG8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5624F6ZZG8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms