Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdh18E9Q9Q6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdh18E9Q9Q6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms