Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srsf11E9Q6E5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srsf11E9Q6E5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms