Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms