Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AU019823E9PUQ3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AU019823E9PUQ3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AU019823E9PUQ3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AU019823E9PUQ3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AU019823E9PUQ3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AU019823E9PUQ3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms