Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc13D3YV10 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms