Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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