Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Nup160Q9Z0W3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Nup160Q9Z0W3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms