Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB5Q9Y5E4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB5Q9Y5E4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB5Q9Y5E4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB5Q9Y5E4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB5Q9Y5E4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB5Q9Y5E4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB5Q9Y5E4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB5Q9Y5E4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms