Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms