Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.65■■■■■ 6.02
NISCHQ9Y2I1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC52.64■■■■■ 6.02
NISCHQ9Y2I1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC52.64■■■■■ 6.02
NISCHQ9Y2I1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC52.64■■■■■ 6.02
NISCHQ9Y2I1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.64■■■■■ 6.02
NISCHQ9Y2I1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.63■■■■■ 6.02
NISCHQ9Y2I1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.63■■■■■ 6.02
NISCHQ9Y2I1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC52.63■■■■■ 6.02
NISCHQ9Y2I1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC52.63■■■■■ 6.02
NISCHQ9Y2I1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC52.63■■■■■ 6.02
NISCHQ9Y2I1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.63■■■■■ 6.02
NISCHQ9Y2I1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.63■■■■■ 6.02
NISCHQ9Y2I1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.62■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC52.62■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC52.62■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC52.62■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC52.62■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.61■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC52.61■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC52.61■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC52.61■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC52.61■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.6■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.6■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.6■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC52.59■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.59■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.59■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC52.59■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC52.59■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC52.59■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC52.59■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC52.58■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC52.58■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC52.58■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.58■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC52.58■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC52.58■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.58■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC52.58■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.58■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.58■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC52.57■■■■■ 6.01
NISCHQ9Y2I1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC52.56■■■■■ 6
NISCHQ9Y2I1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC52.56■■■■■ 6
NISCHQ9Y2I1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC52.55■■■■■ 6
NISCHQ9Y2I1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC52.55■■■■■ 6
NISCHQ9Y2I1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.55■■■■■ 6
NISCHQ9Y2I1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC52.55■■■■■ 6
NISCHQ9Y2I1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.55■■■■■ 6
NISCHQ9Y2I1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.55■■■■■ 6
NISCHQ9Y2I1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC52.55■■■■■ 6
NISCHQ9Y2I1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC52.55■■■■■ 6
NISCHQ9Y2I1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC52.55■■■■■ 6
NISCHQ9Y2I1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC52.55■■■■■ 6
NISCHQ9Y2I1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.54■■■■■ 6
NISCHQ9Y2I1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.53■■■■■ 6
NISCHQ9Y2I1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.52■■■■■ 6
NISCHQ9Y2I1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC52.52■■■■■ 6
NISCHQ9Y2I1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC52.52■■■■■ 6
NISCHQ9Y2I1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC52.52■■■■■ 6
NISCHQ9Y2I1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.51■■■■■ 6
NISCHQ9Y2I1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC52.51■■■■■ 6
NISCHQ9Y2I1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC52.51■■■■■ 6
NISCHQ9Y2I1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC52.51■■■■■ 6
NISCHQ9Y2I1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC52.51■■■■■ 6
NISCHQ9Y2I1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC52.5■■■■■ 6
NISCHQ9Y2I1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC52.5■■■■■ 6
NISCHQ9Y2I1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.5■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC52.5■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC52.5■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC52.5■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.5■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.49■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.49■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.48■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.48■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.48■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC52.48■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC52.48■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC52.48■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC52.47■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC52.47■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC52.47■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC52.47■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC52.47■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC52.47■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC52.46■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.46■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC52.46■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC52.45■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC52.45■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.45■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.45■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.45■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC52.45■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC52.45■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC52.45■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.45■■■■■ 5.99
NISCHQ9Y2I1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC52.44■■■■■ 5.99
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