Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sema6cQ9WTM3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema6cQ9WTM3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6cQ9WTM3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms