Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hic1Q9R1Y5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms