Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Plod3Q9R0E1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plod3Q9R0E1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms