Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a4Q9QZR9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a4Q9QZR9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a4Q9QZR9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a4Q9QZR9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a4Q9QZR9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a4Q9QZR9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a4Q9QZR9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a4Q9QZR9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a4Q9QZR9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a4Q9QZR9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a4Q9QZR9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a4Q9QZR9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a4Q9QZR9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a4Q9QZR9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a4Q9QZR9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a4Q9QZR9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a4Q9QZR9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a4Q9QZR9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a4Q9QZR9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col4a4Q9QZR9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms