Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC17A6Q9P2U8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A6Q9P2U8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms