Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SACSQ9NZJ4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms