Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG3

UBN1, Ubinuclein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN1Q9NPG3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBN1Q9NPG3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms