Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Edf1Q9JMG1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms