Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PnkpQ9JLV6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 229.2 ms