Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmgn5Q9JL35 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmgn5Q9JL35 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms