Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV7

Extl1, Exostosin-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl1Q9JKV7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Extl1Q9JKV7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Extl1Q9JKV7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms