Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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