Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Cldn19Q9ET38 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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Cldn19Q9ET38 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Cldn19Q9ET38 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Cldn19Q9ET38 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
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Cldn19Q9ET38 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Cldn19Q9ET38 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn19Q9ET38 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Cldn19Q9ET38 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Cldn19Q9ET38 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Cldn19Q9ET38 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
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Cldn19Q9ET38 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Cldn19Q9ET38 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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