Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPW9

Tlr6, Toll-like receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr6Q9EPW9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr6Q9EPW9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr6Q9EPW9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms