Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ1

Mlst8, Target of rapamycin complex subunit LST8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mlst8Q9DCJ1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mlst8Q9DCJ1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms