Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Xab2Q9DCD2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms