Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubiad1Q9DC60 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms