Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SrpraQ9DBG7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms