Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms