Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl40Q9D783 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms