Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pfn4Q9D6I3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pfn4Q9D6I3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pfn4Q9D6I3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pfn4Q9D6I3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pfn4Q9D6I3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pfn4Q9D6I3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pfn4Q9D6I3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pfn4Q9D6I3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pfn4Q9D6I3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pfn4Q9D6I3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pfn4Q9D6I3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms