Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930513O06RikQ9D549 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930513O06RikQ9D549 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930513O06RikQ9D549 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930513O06RikQ9D549 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
4930513O06RikQ9D549 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
4930513O06RikQ9D549 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930513O06RikQ9D549 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930513O06RikQ9D549 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930513O06RikQ9D549 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930513O06RikQ9D549 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
4930513O06RikQ9D549 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930513O06RikQ9D549 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930513O06RikQ9D549 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930513O06RikQ9D549 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930513O06RikQ9D549 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930513O06RikQ9D549 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930513O06RikQ9D549 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930513O06RikQ9D549 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930513O06RikQ9D549 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
4930513O06RikQ9D549 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930513O06RikQ9D549 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930513O06RikQ9D549 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930513O06RikQ9D549 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930513O06RikQ9D549 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930513O06RikQ9D549 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930513O06RikQ9D549 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms