Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prpsap1Q9D0M1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpsap1Q9D0M1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prpsap1Q9D0M1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prpsap1Q9D0M1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpsap1Q9D0M1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpsap1Q9D0M1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpsap1Q9D0M1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpsap1Q9D0M1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpsap1Q9D0M1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpsap1Q9D0M1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpsap1Q9D0M1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpsap1Q9D0M1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpsap1Q9D0M1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpsap1Q9D0M1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpsap1Q9D0M1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms