Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Exo5Q9CXP9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Exo5Q9CXP9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Exo5Q9CXP9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Exo5Q9CXP9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Exo5Q9CXP9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Exo5Q9CXP9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Exo5Q9CXP9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Exo5Q9CXP9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Exo5Q9CXP9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Exo5Q9CXP9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Exo5Q9CXP9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Exo5Q9CXP9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Exo5Q9CXP9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Exo5Q9CXP9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Exo5Q9CXP9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Exo5Q9CXP9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Exo5Q9CXP9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Exo5Q9CXP9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Exo5Q9CXP9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Exo5Q9CXP9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Exo5Q9CXP9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Exo5Q9CXP9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Exo5Q9CXP9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms