Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK4

Slc50a1, Sugar transporter SWEET1, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc50a1Q9CXK4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc50a1Q9CXK4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc50a1Q9CXK4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc50a1Q9CXK4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc50a1Q9CXK4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc50a1Q9CXK4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc50a1Q9CXK4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc50a1Q9CXK4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms