Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prkrip1Q9CWV6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prkrip1Q9CWV6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms