Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc96Q9CR92 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 232.4 ms