Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc2Q9CQP2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms