Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid1ip1Q9CQ20 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mid1ip1Q9CQ20 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms