Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN1Q9BY11 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PACSIN1Q9BY11 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms