Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC106Q9BWC9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms