Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rassf3Q99P51 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rassf3Q99P51 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rassf3Q99P51 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rassf3Q99P51 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rassf3Q99P51 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rassf3Q99P51 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rassf3Q99P51 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rassf3Q99P51 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms