Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtpbp4Q99ME9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms