Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CITED2Q99967 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms