Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC2Q96PR1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC2Q96PR1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms