Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cts3Q91ZD5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.4 ms